Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Swt1Q9DBQ9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms