Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtr1Q9DBC3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms