Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms