Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rsph3bQ9DA80 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms