Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calr3Q9D9Q6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Calr3Q9D9Q6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Calr3Q9D9Q6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calr3Q9D9Q6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calr3Q9D9Q6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calr3Q9D9Q6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calr3Q9D9Q6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Calr3Q9D9Q6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Calr3Q9D9Q6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms