Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Pdzd9Q9D9M4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pdzd9Q9D9M4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pdzd9Q9D9M4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pdzd9Q9D9M4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pdzd9Q9D9M4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd9Q9D9M4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd9Q9D9M4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms