Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg7Q9D906 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms