Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd12Q9D8W5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd12Q9D8W5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms