Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gtf3c6Q9D8P7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Gtf3c6Q9D8P7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf3c6Q9D8P7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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