Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D8L0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms