Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh4Q9D8F1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alkbh4Q9D8F1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alkbh4Q9D8F1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms