Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med11Q9D8C6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms