Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms