Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmigd1Q9D7L8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms