Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbe1Q9D6Y9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms