Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc94Q9D6J3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms