Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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