Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc81Q9D5W4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms