Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4f1Q9D5Q6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms