Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms