Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam227bQ9D518 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms