Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox2aQ9D4Y3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms