Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms