Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms