Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms