Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D454 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D454 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D454 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D454 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D454 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D454 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms