Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc6bQ9D289 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trappc6bQ9D289 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trappc6bQ9D289 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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