Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Batf3Q9D275 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Batf3Q9D275 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms