Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erp44Q9D1Q6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms