Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chordc1Q9D1P4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms