Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms