Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms