Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Hddc3Q9D114 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Hddc3Q9D114 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Hddc3Q9D114 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Hddc3Q9D114 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Hddc3Q9D114 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Hddc3Q9D114 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Hddc3Q9D114 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hddc3Q9D114 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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