Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbed3Q9D0L1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms