Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Twist2Q9D030 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Twist2Q9D030 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms