Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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