Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mis18aQ9CZJ6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms