Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2fQ9CY34 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2fQ9CY34 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms