Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms