Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufs4Q9CXZ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms