Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc3Q9CXE6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xrcc3Q9CXE6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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