Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmd8Q9CX56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms