Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc2Q9CX47 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Xrcc2Q9CX47 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Xrcc2Q9CX47 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Xrcc2Q9CX47 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Xrcc2Q9CX47 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Xrcc2Q9CX47 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Xrcc2Q9CX47 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Xrcc2Q9CX47 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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