Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms