Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx2Q9CWK8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx2Q9CWK8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms