Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Atxn3Q9CVD2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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