Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930524J08RikQ9CUJ5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms