Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snw1Q9CSN1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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