Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkiras2Q9CR56 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkiras2Q9CR56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms