Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CR55 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CR55 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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